пятница, 21 декабря 2012 г.

Митохондриальная ДНК

Митохондриальная ДНК (мтДНК) — ДНК, находящаяся (в отличие от ядерной ДНК) в митохондриях, органоидах эукариотических клеток.
Гены, кодированные мтДНК, относятся к группе плазмагенов, расположенных вне ядра (вне хромосомы). Совокупность этих факторов наследственности, сосредоточенных в цитоплазме клетки, составляет плазмон данного вида организмов (в отличие от генома)[1].

Содержание

История открытия

Митохондриальная ДНК была открыта Маргит Насс и Сильвен Насс в 1963 году в Стокгольмском университете при помощи электронной микроскопии[2] и, независимо, учёными Эллен Харлсбруннер, Хансом Туппи и Готтфридом Шацем при биохимическом анализе фракций митохондрий дрожжей в Венском университете в 1964 году.[3]

 Теории возникновения митохондриальной ДНК

Согласно эндосимбиотической теории, митохондриальная ДНК произошла от кольцевых молекул ДНК бактерий и поэтому имеет иное происхождение, чем ядерный геном. Сейчас преобладает точка зрения, согласно которой митохондрии имеют монофилетическое происхождение, то есть были приобретены предками эукариот лишь однажды.
На основании сходства в последовательностях нуклеотидов ДНК ближайшими родственниками митохондрий среди ныне живущих прокариот считают альфа-протеобактерий (выдвигалась также гипотеза, что к митохондриям близки риккетсии). Сравнительный анализ геномов митохондрий показывает, что в ходе эволюции происходило постепенное перемещение генов предков современных митохондрий в ядро клетки. Необъяснимыми с эволюционной точки зрения остаются некоторые особенности митохондриальной ДНК (например, довольно большое число интронов, нетрадиционное использование триплетов и др.). Ввиду ограниченного размера митохондриального генома бо́льшая часть митохондриальных белков кодируется в ядре. При этом бо́льшая часть митохондриальных тРНК кодируются митохондриальным геномом.

[править] Формы и число молекул митохондриальной ДНК


Электронная микроскопия демонстрирует определённую локализацию мтДНК в митохондриях человека. Разрешение 200 нм. (A) Сечение через цитоплазму после окрашивания мтДНК частичками золота. (B) Цитоплазма после экстракции; мтДНК, связанные с частичками золота, остались на месте. Из статьи Iborra et al., 2004.[4]
У большинства изученных организмов митохондрии содержат только кольцевые молекулы ДНК, у некоторых растений одновременно присутствуют и кольцевые, и линейные молекулы, а у ряда протистов (например, инфузорий) имеются только линейные молекулы.[5]
Митохондрии млекопитающих обычно содержат от двух до десяти идентичных копий кольцевых молекул ДНК.[6]
У растений каждая митохондрия содержит несколько молекул ДНК разного размера, которые способны к рекомбинации.
У протистов из отряда кинетопластид (например, у трипаносом) в особом участке митохондрии (кинетопласте) содержится два типа молекул ДНК — идентичные макси-кольца (20-50 штук) длиной около 21 т.п.о. и мини-кольца (20 000 — 55 000 штук, около 300 разновидностей, средняя длина около 1000 п.о.). Все кольца соединены в единую сеть (катенаны), которая разрушается и восстанавливается при каждом цикле репликации. Макси-кольца гомологичны митохондриальной ДНК других организмов. Каждое мини-кольцо содержит четыре сходных консервативных участка и четыре уникальных гипервариабельных участка.[7] В мини-кольцах закодированы короткие молекулы направляющих РНК (guideRNA), которые осуществляют редактирование РНК, транскрибируемых с генов макси-колец.

[править] Устойчивость митохондриальной ДНК

Митохондриальная ДНК особенно чувствительна к активным формам кислорода, генерируемым дыхательной цепью, в связи с непосредственной их близостью. Хотя митохондриальная ДНК связана с белками, их защитная роль менее выражена, чем в случае ядерной ДНК. Мутации в ДНК митохондрий могут вызывать передаваемые по материнской линии наследственные заболевания. Также имеются данные, указывающие на возможный вклад мутаций митохондриальной ДНК в процесс старения и развитие возрастных патологий.[8] У человека митохондриальная ДНК обычно присутствует в количестве 100—10000 копий на клетку (сперматозоиды и яйцеклетки являются исключением). С множественностью митохондриальных геномов связаны особенности проявления митохондриальных болезней — обычно позднее их начало и очень изменчивые симптомы.

[править] Митохондриальная наследственность

[править] Наследование по материнской линии

У большинства многоклеточных организмов митохондриальная ДНК наследуется по материнской линии. Яйцеклетка содержит на несколько порядков больше копий митохондриальной ДНК, чем сперматозоид. В сперматозоиде обычно не больше десятка митохондрий (у человека — одна спирально закрученная митохондрия), в небольших яйцеклетках морского ежа — несколько сотен тысяч, а в крупных ооцитах лягушки — десятки миллионов. Кроме того, обычно происходит деградация митохондрий сперматозоида после оплодотворения.[9]
При половом размножении митохондрии, как правило, наследуются исключительно по материнской линии, митохондрии сперматозоида обычно разрушаются после оплодотворения. Кроме того, большая часть митохондрий сперматозоида находятся в основании жгутика, которое при оплодотворении иногда теряется. В 1999 году было обнаружено, что митохондрии сперматозоидов помечены убиквитином (белком-меткой, которая приводит к разрушению отцовских митохондрий в зиготе).[10]
Так как митохондриальная ДНК не является высококонсервативной и имеет высокую скорость мутирования, она является хорошим объектом для изучения филогении (эволюционного родства) живых организмов. Для этого определяют последовательности митохондриальной ДНК у разных видов и сравнивают их при помощи специальных компьютерных программ и получают эволюционное древо для изученных видов. Исследование митохондриальных ДНК собак позволило проследить происхождение собак от диких волков.[11] Исследование митохондриальной ДНК в популяциях человека позволило вычислить «митохондриальную Еву», гипотетическую прародительницу всех живущих в настоящее время людей.

[править] Наследование по отцовской линии

Для некоторых видов показана передача митохондриальной ДНК по мужской линии, например, у мидий[12][13]. Наследование митохондрий по отцовской линии также описано для некоторых насекомых, например, для дрозофилы,[14] медоносных пчел[15] и цикад.[16]
Существуют также данные о митохондриальном наследовании по мужской линии у млекопитающих. Описаны случаи такого наследования для мышей,[17][18] при этом митохондрии, полученные от самца, впоследствии отторгаются. Такое явление показано для овец [19] и клонированного крупного рогатого скота.[20] Также описан единственный случай связанный с бесплодием у мужчины.[21].

[править] Геном митохондрий

У млекопитающих каждая молекула мтДНК содержит 15000-17000 пар оснований (у человека 16565 пар нуклеотидов — исследование закончено в 1981 году[22], по другому источнику 16569 пар[23]) и содержит 37 генов — 13 кодируют белки, 22 — гены тРНК, 2 — рРНК (по одному гену для 12S и 16S рРНК). Другие многоклеточные животные имеют схожий набор митохондриальных генов, хотя некоторые гены могут иногда отсутствовать. Генный состав мтДНК разных видов растений, грибов и особенно протистов [24] различается более значительно. Так, у жгутиконосца-якобиды Reclinomonas americana найден наиболее полный из известных митохондриальных геномов: он содержит 97 генов, в том числе 62 гена, кодирующих белки (27 рибосомальных белков, 23 белка, участвующих в работе электрон-транспортной цепи и в окислительном фосфорилировании, а также субъединицы РНК-полимеразы).
Один из наиболее маленьких митохондриальных геномов имеет малярийный плазмодий (около 6.000 п.о., содержит два гена рРНК и три гена, кодирующих белки).
Недавно открытые рудиментарные митохондрии (митосомы) некоторых протистов (дизентерийной амёбы, микроспоридий и лямблий) не содержат ДНК.[25]
Митохондриальные геномы различных видов грибов содержат от 19 431 (делящиеся дрожжи Schizosaccharomyces pombe) до 100 314 (сордариомицет Podospora anserina) пар нуклеотидов[26].
Некоторые растения имеют огромные молекулы митохондриальной ДНК (до 25 миллионов пар оснований), при этом содержащие примерно те же гены и в том же количестве, что и меньшие мтДНК. Длина митохондриальной ДНК может широко варьировать даже у растений одного семейства. В митохондриальной ДНК растений имеются некодирующие повторяющиеся последовательности.
Геном человека содержит только по одному промотору на каждую комплементарную цепь ДНК[22].
Геном митохондрий человека кодирует следующие белки и РНК:
Белки или РНК Гены
NADH-дегидрогеназа
(комплекс I)		 MT-ND1, MT-ND2, MT-ND3, MT-ND4, MT-ND4L, MT-ND5, MT-ND6
Кофермент Q - цитохром c редуктаза/Цитохром b
(комплекс III)		 MT-CYB
цитохром c оксидаза
(комплекс IV)		 MT-CO1, MT-CO2, MT-CO3
АТФ-синтаза MT-ATP6, MT-ATP8
рРНК MT-RNR1 (12S), MT-RNR2 (16S)
тРНК MT-TA, MT-TC, MT-TD, MT-TE, MT-TF, MT-TG, MT-TH, MT-TI, MT-TK, MT-TL1, MT-TL2, MT-TM, MT-TN, MT-TP, MT-TQ, MT-TR, MT-TS1, MT-TS2, MT-TT, MT-TV, MT-TW, MT-TY, MT1X

[править] Особенности митохондриальной ДНК

Кодирующие последовательности (кодоны) митохондриального генома имеют некоторые отличия от кодирующих последовательностей универсальной ядерной ДНК.
Так, кодон AUA кодирует в митохондриальном геноме метионин (вместо изолейцина в ядерной ДНК), кодоны AGA и AGG — терминаторные кодоны (в ядерной ДНК кодируют аргинин), кодон UGA в митохондриальном геноме кодирует триптофан[22].
Если говорить точнее, то речь идёт не о митохондриальной ДНК, а о мРНК, которая списывается (транскрибируется) с этой ДНК перед началом синтеза белка. Буква U в обозначении кодона обозначает уридин, который при транскрипции гена в РНК заменяет тимин.
Количество генов тРНК (22 гена) меньше, чем в ядерном геноме с его 32 генами тРНК[22].
В человеческом митохондриальном геноме информация настолько сконцентрирована, что в последовательностях кодирующих мРНК, как правило, частично удалены нуклеотиды, соответствующие 3'-концевым терминаторным кодонам[22].

[править] Применение

Кроме изучения для построения различных филогенетических теорий, изучение митохондриального генома — основной инструмент при проведении идентификации. Возможность идентификации связана с существующими в митохондриальном геноме человека групповыми и даже индивидуальными различиями.

[править] Примечания

↑ Показывать компактно
  1. ↑ Джинкс Д., Нехромосомная наследственность, пер. с англ., М., 1966; Сэджер Р., Гены вне хромосом, в кн.: Молекулы и клетки, пер. с англ., М., 1966.
  2. ↑ Nass, M.M. & Nass, S. (1963 at the Wenner-Gren Institute for Experimental Biology, Stockholm University, Stockholm, Sweden): Intramitochondrial Fibers with DNA characteristics (PDF). In: J. Cell. Biol. Bd. 19, S. 593—629. PMID 14086138
  3. ↑ Ellen Haslbrunner, Hans Tuppy and Gottfried Schatz (1964 at the Institut for Biochemistry at the Medical Faculty of the University of Vienna in Vienna, Австрия): «Deoxyribonucleic Acid Associated with Yeast Mitochondria» (PDF) Biochem. Biophys. Res. Commun. 15, 127—132.
  4. ↑ Iborra FJ, Kimura H, Cook PR (2004). «The functional organization of mitochondrial genomes in human cells». BMC Biol. 2: 9. DOI:10.1186/1741-7007-2-9. PMID 15157274.
  5. ↑ Дымшиц Г. М. Сюрпризы митохондриального генома. Природа, 2002, N 6 [1]
  6. ↑ Wiesner RJ, Ruegg JC, Morano I (1992). «Counting target molecules by exponential polymerase chain reaction, copy number of mitochondrial DNA in rat tissues». Biochim Biophys Acta. 183: 553–559. PMID 1550563.
  7. ↑ doi:10.1016/j.exppara.2006.04.005
  8. ↑ (July 2004) «Mitochondrial DNA and aging». Clinical Science 107 (4): 355–364. DOI:10.1042/CS20040148. PMID 15279618.
  9. ↑ Ченцов Ю. С. Общая цитология. — 3-е изд. — МГУ, 1995. — 384 с. — ISBN 5-211-03055-9
  10. ↑ Sutovsky, P., et. al (Nov. 25, 1999). «Ubiquitin tag for sperm mitochondria». Nature 402: 371–372. DOI:10.1038/46466. PMID 10586873. Discussed in [2].
  11. ↑ Vilà C, Savolainen P, Maldonado JE, and Amorin IR (13 June 1997). «Multiple and Ancient Origins of the Domestic Dog». Science 276: 1687–1689. DOI:10.1126/science.276.5319.1687. ISSN 0036-8075. PMID 9180076.
  12. ↑ Hoeh WR, Blakley KH, Brown WM (1991). «Heteroplasmy suggests limited biparental inheritance of Mytilus mitochondrial DNA». Science 251: 1488–1490. DOI:10.1126/science.1672472. PMID 1672472.
  13. ↑ Penman, Danny. Mitochondria can be inherited from both parents, NewScientist.com (23 August 2002). Проверено 5 февраля 2008.
  14. ↑ Kondo R, Matsuura ET, Chigusa SI (1992). «Further observation of paternal transmission of Drosophila mitochondrial DNA by PCR selective amplification method». Genet. Res. 59 (2): 81–4. PMID 1628820.
  15. ↑ Meusel MS, Moritz RF (1993). «Transfer of paternal mitochondrial DNA during fertilization of honeybee (Apis mellifera L.) eggs». Curr. Genet. 24 (6): 539–43. DOI:10.1007/BF00351719. PMID 8299176.
  16. ↑ Fontaine, KM, Cooley, JR, Simon, C (2007). «Evidence for paternal leakage in hybrid periodical cicadas (Hemiptera: Magicicada spp.)». PLoS One. 9: e892. DOI:10.1371/journal.pone.0000892.
  17. ↑ Gyllensten U, Wharton D, Josefsson A, Wilson AC (1991). «Paternal inheritance of mitochondrial DNA in mice». Nature 352 (6332): 255–7. DOI:10.1038/352255a0. PMID 1857422.
  18. ↑ Shitara H, Hayashi JI, Takahama S, Kaneda H, Yonekawa H (1998). «Maternal inheritance of mouse mtDNA in interspecific hybrids: segregation of the leaked paternal mtDNA followed by the prevention of subsequent paternal leakage». Genetics 148 (2): 851–7. PMID 9504930.
  19. ↑ Zhao X, Li N, Guo W, et al (2004). «Further evidence for paternal inheritance of mitochondrial DNA in the sheep (Ovis aries)». Heredity 93 (4): 399–403. DOI:10.1038/sj.hdy.6800516. PMID 15266295.
  20. ↑ Steinborn R, Zakhartchenko V, Jelyazkov J, et al (1998). «Composition of parental mitochondrial DNA in cloned bovine embryos». FEBS Lett. 426 (3): 352–6. DOI:10.1016/S0014-5793(98)00350-0. PMID 9600265.
  21. ↑ Schwartz M, Vissing J (2002). «Paternal inheritance of mitochondrial DNA». N. Engl. J. Med. 347 (8): 576–80. DOI:10.1056/NEJMoa020350. PMID 12192017.
  22. ↑ 1 2 3 4 5 Айала Ф. Д. Современная генетика. 1987.
  23. ↑ http://chemistry.umeche.maine.edu/CHY431/MitoDNA.html
  24. ↑ MW Gray, BF Lang, R Cedergren, GB Golding, C Lemieux, D Sankoff, M Turmel, N Brossard, E Delage, TG Littlejohn, I Plante, P Rioux, D Saint-Louis, Y Zhu and G Burger (1998). «Genome structure and gene content in protist mitochondrial DNAs». Nucleic Acids Research 26: 865-878.http://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/26/4/865
  25. ↑ en:Mitosome#cite_note-Leon04-7
  26. ↑ Дьяков Ю. Т., Шнырева А. В., Сергеев А. Ю. Введение в генетику грибов. — М.: изд. центр «Академия», 2005. — С. 52. — ISBN 5-7695-2174-0

[править] Ссылки

Автор: на
Ярлыки:

15 комментариев:

  1. Strannik21 декабря 2012 г. в 14:43

    Просьба ссылаться на источники. Ну нету и быть не может у Фогеля или Ленинджера утверждений о том, что "митохондрии это органы", тем более нет там ничего про "диагональный способ записи генетического кода", про то, что "мтДНК не содержит некодирующих участков" и прочая, и прочая. Текст, содержащий ошибок примерно раз в 10 больше, чем полезной информации должен быть удалён, и улучшению не подлежит. Табличка с митохондриальным генетическим кодом в статье совершенно бесполезна, потому что биосинтез белка не является предметом статьи. Shureg 15:02, 3 декабря 2008 (UTC)

    Табличка как раз пусть бы была, в других статьях ее вроде нет... --Victoria 15:08, 3 декабря 2008 (UTC)

    В любом случае таблица сама по себе бесполезна, она должна что-то иллюстрировать. Например текст про особенности генетического кода в митохондриях. А его нет, есть весьма странные "мысли по поводу". Думаю, оптимальный вариант - универсальная табличка в статье генетический код и сводная таблица отклонений от оного.Shureg 15:15, 3 декабря 2008 (UTC)

    Ну для начала, Вы проштудируйте статей этак 100 по МК. Nessy.

    Перечисление книг - это ещё не ссылки на источники. Nessy, какие именно факты Вы позаимствовали из прекрасной книжки Франка-Каменецкого (держу её в руках, кстати, она и онлайн доступна)? Shureg 15:57, 3 декабря 2008 (UTC)

    Ну, что, порассуждали вдвоем, без комментариев, оставляйте админы и backpipers, то, что считаете по правилам орфографии и лингвистики, если будут вопросы обращайтесь. Всё остальное - это претензии Shureg Сектора придумал Макс и их мне показал, Вы не читаете оригиналы, в этом проблема, я найду книгу Макса и покажу страницу, бойтесь. Ну а если я Вам покажу Трифонова Эдуарда, видимо совсем будет плохо. --Nessy 17:09, 3 декабря 2008 (UTC) Я по моему понял, в конце концов, что имеет в виду Shureg, но я не понял почему он это не исправляет, а уничтожает частично, полностью или переписывает статьи. Мы совершаем ошибки, когда пишем, по правильному надо вернуть истинный текст. То есть человек не понимает грамматического и орфографического сбоя и пытается КАК-ТО его восстановить. Мне одно непонятно, как такой инструктор стал исправляющим? По моему разумению, хотелось бы отправить такого инспектора в область, где действительно нужны люди, способные исправлять аномалии. --Nessy 17:44, 3 декабря 2008 (UTC)


    Показывайте, именно этого от Вас и хотят.. Поскольку не услышал ни слова, относящегося к тексту статьи, возвращаю не содержащий оригинальных исследований вариант. --Shureg 17:31, 3 декабря 2008 (UTC)

    ОтветитьУдалить
  2. Strannik21 декабря 2012 г. в 14:45

    Не вижу смысла в использовании этих устаревших и бесполезных терминов. Чрезвычайно "смелая" фраза о том, что митохондрия - это симбиотический организм, меня тоже не устраивает. Прошу привести авторитетные источники (чисто формально, поскольку ясно, что таковых нет). --Shureg 22:42, 4 февраля 2009 (UTC)

    О симбиотических отношениях митохондрий и клетки много авторитетных источников. Один я привёл. Можно ещё. Вопрос об устаревании каких-либо терминов - есть вопрос сиюминутный. Между тем, симбиотичность отношений клетки и митохондрии установлена. Их геномы - принадлежат разным существам. На мой взгляд, если в Википедии будут отражены даже мельчайшие подробности существа проблемы статьи, это пойдёт на пользу и самой Википедии, и её потребителей. Насчёт удалённого участка сообщаю: не знал, извините, что не поставил в виде цитаты. Но взял ёё не с указанного сайта, а из журнала "Вестник новых медицинских технологий", № 1, 2009. Предлагаю оставить фразу, поставив её в кавычки и дав указанный мной источник.--A-ktubu 09:48, 5 февраля 2009 (UTC)

    Практически установленным можно считать симбиотическое происхождение митохондрий от альфапротеобактерий. К тому же вы приводите источник 68-го года, когда даже это было лишь гипотезой. А вот о том, что митохондрии считаются отдельными организмами, я в первый раз слышу. Митохондрии - это не организмы, не клетки, не эндосимбионты. Вот, к примеру сюда можно заглянуть. --Shureg 15:44, 5 февраля 2009 (UTC)
    Насчёт цитаты - опусы тов. Тюняева, не имеющего биологического образования, все без исключения подпадают под правило ВП:МАРГ,и авторитетными источниками не являются. --Shureg 15:50, 5 февраля 2009 (UTC)

    Прошу прощения, что вмешиваюсь в Ваш разговор, но то, что Вы, Shureg, назвали "опусом" опубликовано в уважаемом биологическом журнале. Вот что о нем нашёл на сайте ВАК: Перечень ведущих рецензируемых научных журналов и изданий, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертации на соискание ученой степени доктора* и кандидата наук - "Вестник новых медицинских технологий* 72895 по медицине; по биологическим наукам" (см. стр. 3). Наверное, редколлегия журнала думала, прежде, чем публиковать названную Вами "опусом" статью.--Socialotvet 16:43, 5 февраля 2009 (UTC)

    Да, периодически в этот список попадают недоразумения вроде этого "уважаемого" журнала, издаваемого тем же Тюняевым. Авторитетность определяется не только наличием в ВАКовских списках. Та статья хоть где-то цитировалась? Независимые аналогичные (про организмы-митохондрии) утверждения где-нибудь есть? --Shureg 17:53, 5 февраля 2009 (UTC)

    О! Уважаемый, Shureg! Вы уже и ВАК обругали! Даже не посмотрев, кому принадлежит журнал. А позвольте спросить Вас: Вы кто в биологии, чтобы судить ВАКовские списки и обзывать их "недорозумениями"? (Я без агрессии, просто интересно: так, огульно Вы рапространяетесь...) А цитирование... Так, 1-й же номер. Когда же цитировать-то успели? Да и не цитированием статьи уважаются, а самим фактом публикации в реферируемом (ВАК) журнале. Моё предложение: давайте не будем подменять собой экспертный совет ВАК, а просто станем уважать избранные им издания :)--Socialotvet 18:23, 5 февраля 2009 (UTC)

    ОтветитьУдалить
  3. Strannik21 декабря 2012 г. в 14:45


    См.Википедия:АИ#Является ли автор уважаемым экспертом в данной области? --Shureg 18:46, 5 февраля 2009 (UTC)

    Отвечаю по пунктам правил:

    Публиковались ли работы автора по данной теме в авторитетных научных журналах? - Да, публиковались. Журналы ВАК: "Вестник новых медицинских технологий" (5 публикаций); "Естественные и технические науки" (7 публ. за 2008 год) и др.
    Были ли получены негативные отзывы от известных экспертов в данной области на предыдущие или нынешнюю публикации автора? - Нет. Негативных отзывов не было. Были положительные.
    Ссылаются ли на работы автора как на достоверный источник другие авторы, работающие в данной области, в своих статьях (также опубликованных в научных журналах)? - Да, ссылаются. С учетом, конечно, того, что автор публикуется с 2007 - 2008 гг.
    Я думаю, всё-таки следует изменить своё негативное отношение к автору :) Socialotvet 19:06, 5 февраля 2009 (UTC)

    А можно поподробнее про положительные отзывы от экспертов в данной области (а именно - в области клеточной или молекулярной биологии)? --Shureg 19:22, 5 февраля 2009 (UTC)

    ОтветитьУдалить
  4. Strannik21 декабря 2012 г. в 14:45


    Насчёт устаревания понятия "плазмон" и "плазмогены" Вы, уважаемый Shureg, явно отстали :) Вот, например, работа Orlov P.A., Mavrishcheva E.B., Palilova A.N. Genome and plasmon interaction in induction of morphogenetic response of wheat plants in anther culture. // Russian Journal of Genetics. - 1995. V. 31. - № 3. - P. 333-336. (выделено мной). К сведению, Orlov P.A. - зав. лабораторией Генетики морфогенеза Института генетики и цитологии. Эта работа, как Вы видите, свежая - 1995 года.

    Насчёт вашего спора с Socialotvet несколько слов скажу: публикация в реферируемом журнале (ВАК) возможна только в случае получения на публикуемый материал двух и более положительных рецензий специалистов. Поэтому сам факт публикации говорит о существования двух или более положительных рецензий. Если такая практика в журнале не соблюдается, то журнал НЕ БУДЕТ включен в список ВАК.
    Моё мнение: факт публикации в любом издании ВАК РАН является свидетельством достоверности источника (в противном случае Википедия ставит себя выше РАН :)) ) A-ktubu 20:12, 5 февраля 2009 (UTC)

    Журнал ВАК РАН, безусловно, является АИ. Если есть АИ, которые противоречат друг другу, мы призываем к помощи здравый смысл, ищем АИ, тираж которых на порядки выше, например, англоязычные, например, Cell, Nature, Science. Хотя последние об употреблении устаревших русскоязычных терминов вряд ли в курсе. --Jegres Hydes (sirozha.ru) 03:32, 6 февраля 2009 (UTC)

    Вот, и хорошо. С журналами разобрались. Теперь - с судьями :) Вы, Jegres Hydes (sirozha.ru), только что окончили ВУЗ - вопрос о взаимосвязи генома и плазмона поднят на страницах журнала ВАК. Вы, говоря об "устаревшести" терминов, ставите себя выше редколлегии журнала, состоящей из уже устоявшихся профессионалов. На мой взгляд, это не правильно. Поэтому ввожу дополнительный подраздел (дается примерный текст). Ссылки и уточнения введу позже. Ещё раз уточняю: то, что плазмон и геном разные системы разных организмов, в этой статье крайне важно, потому что по мтДНК выводить наследственность так же, как, например, выводить наследственность по вирусам ГРИППа. A-ktubu 09:39, 6 февраля 2009 (UTC)

    Значит о судьях, например когда я читаю учебники 1948 года выпуска, рассматриваю их исключительно с методическим интересом, и не стараюсь состояние науки на 1948 год перенести в свободную (от бреда) энциклопедию в интернете, если кто-то так делает, это его право, но право грамотных людей на это адекватно прореагировать и поправить в современную сторону. Если вас, участник с красным именем, так интересует плазмон, пишите соответствующую статью, мы ее почитаем, дополним, исправим, и если получится номинируем в хорошие. Я не читал тот журнал ВАК, о котором идет речь, если вы его читали и можете доказать существование данной статьи, и выложить куда нибудь сканы страниц журнала, мы вам скажем спасибо и примем к сведению, что в журналах ВАК (которые для нас АИ) публикуют статьи с использованием терминов из газет 1948 года. Ваше предложение Ещё раз уточняю: то, что плазмон и геном разные системы разных организмов, в этой статье крайне важно, потому что по мтДНК выводить наследственность так же, как, например, выводить наследственность по вирусам ГРИППа как будто писал электронный переводчик с русского на китайский, с китайского на японский и с японского на русский. Предложение не согласовано и понять вашу мысль совершенно не возможно, другие участники меня поддержат. Ваша правка также далека от энциклопедического стиля, и мне пришлось ее поправить (и литературную часть и науку) до такой степени, что правка исчезла. Очень жаль. Да, когда будете выводить наследственность по вирусам гриппа, пошлите статью в журнал ВАК, вас там поймут быстрее, чем здесь --Jegres Hydes (sirozha.ru) 18:17, 6 февраля 2009 (UTC)

    ОтветитьУдалить
  5. Strannik21 декабря 2012 г. в 14:46

    Связь генома мтДНК с геномом человека

    Гены мтДНК составляют плазмон, в который, в свою очередь, входят нехромосомные и неядерные гены. Плазмон не связан с наследственностью человека, поскольку наследственность передаётся хромосомными генами. Поэтому выявляемая в некоторых случаях плазматическая наследственность не соответствует законам Менделя.

    Указываю на фактические ошибки

    Название раздела не отражает сути информации, которая в нем изложена
    Раздел не викифицирован
    мтДНК не является общепризнанным сокращением в реферируемой русскоязычной литературе
    нехромосомные гены суть неядерные гены, в первом предложении, на усмотрение участников - каламбур или фактическая ошибка
    наследственность человека определяется всеми генами, которые есть в клетках человека, в том числе и генами митохондрий, таким образом, во втором предожении фактическая ошибка. Шире об этом пойдет речь после полного перевода английской статьи.
    цитоплазматическая наследственность полностью соответствует законам Менделя, если учесть, что цитоплазматические гены наследуются по материнской линии. в третьем предложении фактическая ошибка.

    ОтветитьУдалить
  6. Strannik21 декабря 2012 г. в 14:47

    Цитируя классиков

    работу Orlov P.A., Mavrishcheva E.B., Palilova A.N. Genome and plasmon interaction in induction of morphogenetic response of wheat plants in anther culture. // Russian Journal of Genetics. - 1995. V. 31. - № 3. - P. 333-336. «свежей» может назвать только человек (оскорбление скрыто), конечно, не 1948 год, но именно свежей может являться работа максимум 1998-2003 года, у меня есть уверенность, что товарищ Орлов et. al. с 1995 года написал еще множество статей по данной теме, нельзя ли с ними ознакомиться?

    Кстати, эта статья не находится в pubmed (какая жалость и досада, ВАКовский журнал не любят не только грамотные молекулярщики, но и буржуйский пабмед), зато находится такая [Variation in evolutionary unstable regions of the chloroplast genome in plants obtained in anther culture of dihaploid wheat lines] Mozgova GV, Orlov PA, Shalygo NV. Genetika. 2006 Feb;42(2):192-7. Russian. получается, что журнал Генетика ставит себя выше публикаций 1948 года и не разрешает товарищу Орлову с соавторами написать в названии плазмон, а только геном хлоропластов. Интересно, Генетика и Российский журнал генетики это одно и то же? И какой импакт у Российского журнала генетики, если не одно и то же.

    За сим откланиваюсь --Jegres Hydes (sirozha.ru) 18:09, 6 февраля 2009 (UTC)

    ОтветитьУдалить
  7. Strannik21 декабря 2012 г. в 14:48

    Во-первых, Victoria, Вы не модифицировали его правки и не удалили оскорбления в мой адрес, хотя и написали об этом в прошедшем времени. Во-вторых, Вы - кандидат биологических наук и разбираетесь в вопросе, как Вы сами написали. Зачем тогда Вам ещё нужны авторитетные источники? Повторюсь:

    1. Наследственность передаётся хромосомными (ядерными) генами.
    2. Гены митохондрий не входят в хромосомы.
    3. Следовательно, наследственность генами митохондрий не передаётся.

    Вот лично для Вас две работы из указанной области - Джинкс Д., Нехромосомная наследственность, пер. с англ., М., 1966; Сэджер Р., Гены вне хромосом, в кн.: Молекулы и клетки, пер. с англ., М., 1966. Неужели этого недостаточно профессионалу? Оставьте мою правку, пусть даже, как примечание A-ktubu 00:47, 8 февраля 2009 (UTC) A-ktubu 00:45, 8 февраля 2009 (UTC)

    A-ctubu, третье утверждение не следует из первых двух. Наследственная информация передаётся и генами ядерного генома, и митохондриальными генами. Обратное расскажите людям с наследственными заболеваниями, обусловленными мутациями в мтДНК. Теперь насчёт Евы. Митохондриальная ДНК подходит для филогенетических исследований даже лучше, чем ядерная, потому что митохондрии, вместе с митохондриальным геномом передаются практически исключительно по материнской линии. Если бы вы указали главу и страницу книги, где, по-вашему, утверждается, что "наследственность генами митохондрий не передаётся", можно было бы продолжить разговор. Да, и надеюсь, что на личности переходить никто из участников более не будет. Это не только оскорблений касается, но и рассуждений о том, кто какой факультет закончил и какого цвета подпись.--Shureg 06:24, 8 февраля 2009 (UTC)

    Первое утверждение неполное, второе утверждение очевидное, третье утверждение неверное и не следует из первых двух. --Jegres Hydes (sirozha.ru) 13:44, 8 февраля 2009 (UTC)

    A-ktubu, указанные Вами оскорбления я вчера удалила [1], но при более внимательном рассмотрении оказалось, что этого недостаточно. Тут нужен был не терапевтический, а хирургический подход, удален весь раздел. По некоторым Вашим замечаниям ответил Shureg, по остальному скажу, что проверяемость — это основа энциклопедии, очень мало есть утверждений, которые не должны снабжаться ссылками на авторитетные источники (АИ), и чем более необычно утверждение, тем авторитетней должны быть АИ. Я знакома с современной (статьи в научных журналах за последние 5 лет) литературой по этому вопросу и хочу отметить, что Ваши выводы из факта симбиотического происхождения митохондрий очень необычны и подпадают под действие ВП:МАРГ. Victoria 09:19, 8 февраля 2009 (UTC)

    ОтветитьУдалить
  8. Strannik21 декабря 2012 г. в 14:48


    Ладно, Victoria, спорить не буду, а то правда в маргиналы запишете :)
    Я думал, что публикация в журнале ВАК является АИ, а не маргинальным. Но сообществу видней - все же биологи :).
    Что особенно удивляет, так это отсутствие логики. Повторюсь. Если наследственность кодируется хромосомными генами, а также гены митохондрий кодируются хромосомными генами, то какое место занимают гены самих митохондрий в хромосомах человека и, то есть, в его наследственности?
    Интересно, в проекте "Википедия" написанное на личных страницах совпадает с действительностью? А то я, например, могу назваться академиком РАН. Это как-то проверяется?
    Ваша фраза "Ваши выводы из факта симбиотического происхождения митохондрий очень необычны"... Я даже не знаю, как прокомментировать, не повторяясь :( Но в связи с ней у меня к Вам личная просьба: если в Вашем окружении есть доктор наук этой специальности, то разберите с ним эту ситуацию. И, если не трудно, сообщите мне результаты. Крайне интересны мнения. Может, они, наконец-то, прольют ДОСТАТОЧНЫЙ свет на эту простую, но почему-то спорную, ситуацию :)
    С самыми дружескими пожеланиями A-ktubu 15:10, 8 февраля 2009 (UTC)

    ОтветитьУдалить
  9. Strannik21 декабря 2012 г. в 14:49


    Извините, но в вашем вопросе содержится несколько неточностей:

    Наследственность зависит не только от хромосомальных генов, а от совокупности всех генов организма, в том числе генов митохондрий (у животных) и пластид (у растений);
    Гены митохондий независимы от хромосомальных генов, и никак не могут ими кодироваться;
    Аналогично, они в состав хромосом не входят.

    Я не считаю необходимым доказывать Вам, что информация на моей странице соответствует реальности. Либо вы мне верите, либо нет. К сожалению, докторов наук в моем окружении нет, поскольку британская система не соответствует двухступенчатой французской. Засим позвольте дискуссию считать законченной. Если после окончания защиты Вы продолжите добавлять материал, без конкретных ссылок на указание страницы, откуда взята информация, придется применить ВП:ВОЙ --Victoria 00:02, 9 февраля 2009 (UTC)

    ОтветитьУдалить
  10. Strannik21 декабря 2012 г. в 14:49



    Уважаемая Victoria! Я не просил Вас чего-либо доказывать. Мой вопрос касался участников вообще. A-ktubu 20:55, 9 февраля 2009 (UTC)

    Участник A-ktubu, поясните, пожалуйста, какое отношение журнал ВАК имеет к определению понятия наследственности. Вы оперируете этим безымянным журналом ВАК и в пользу понятия Плазмон_(биология) и в пользу того, что митохондриальные гены не участвуют в наследственности. Оба этих момента отражены в журнале ВАК в статье про плазмон? или остались какие то статьи, о которых другим участникам проекта неизвестно? --Jegres Hydes (sirozha.ru) 03:03, 9 февраля 2009 (UTC)

    ОтветитьУдалить
  11. Strannik21 декабря 2012 г. в 14:50

    Ваш вопрос меня поставил в тупик. То, что Вы от меня требуете, я никогда не утверждал. И лжёте: журнал был назван - "Вестник новых медицинских технологий", и дана ссылка на него в списке ВАК. Моя настойчивость,

    во-первых, касалась того, чтобы Вы относились к журналам ВАК как к авторитетным источникам и не ставили свои мнения выше рецензентов журнала, пропустивших статью к публикации.
    во-вторых, я хотел бы, чтобы в статье было отражено, что мтДНК не входит в геном, а является составной частью плазмона (если термин, по-вашему, с 1995 года устарел, то дайте новый термин. Не принципиально).
    в-третьих, поскольку мтДНК не входит в геном, то в статье целесообразно отразить сомнения по поводу передачи наследственных факторов с помощью генов, кодируемых мтДНК.
    Я просто хочу сделать статью НЕ ЛОЖНОЙ и не вводящей читателя в заблуждение. То, что некоторые "ученые" считают мтДНК способной передавать наследственные признаки - это их проблема: со временем осознают, может быть. Но участники Википедии не могут позволить себе так заблуждаться. Я попытаюсь раздобыть скан упомянутой Вами статьи и тогда со ссылкой на страницу и конкретную цитату прошу ввести тот кусок текста, за который я воюю :)) Договорились? A-ktubu 20:55, 9 февраля 2009 (UTC)

    Дубль шестой. К вашей позиции по плазмону вопросов не осталось. Вопросы есть к тому, что митохондриальная ДНК не принимает участие к наследственности. Если вы предоставите АИ, в которых будет указано, что митохондриальная ДНК неспособна принимать участие в наследовании, или что вклад ее сомнителен, это будет фурор в науке. Уважаемая администратор Виктория писала, что знакома с текущим положением в науке и за последние пять лет не встречала такой позиции (что гены митохондрий не принимают участие в наследовании признаков у человека) в реферируемых журналах. Я могу предоставить АИ, которые считают цитоплазматические гены компонентами, обеспечивающими наследование кодируемых признаков — например, Molecular biology of the cell, fifth edition, Alberts et. al, p. 864—866.--Jegres Hydes (sirozha.ru) 04:55, 10 февраля 2009 (UTC)
    Я просто хочу сделать статью НЕ ЛОЖНОЙ и не вводящей читателя в заблуждение. То, что некоторые "ученые" считают мтДНК способной передавать наследственные признаки - это их проблема: со временем осознают, может быть. Но участники Википедии не могут позволить себе так заблуждаться. а вот это, кажется, называют викитроллинг... --Jegres Hydes (sirozha.ru) 04:55, 10 февраля 2009 (UTC)

    ОтветитьУдалить
  12. Strannik21 декабря 2012 г. в 14:50


    Что такое "викитроллинг"?
    Про фурор знаю.
    В сотый раз тяжело, но поясню. Вы, скорее всего, должны меня понять.

    1. Ядерные гены мультигенно кодируют образование всех систем организма, включая образование митохондрий.
    2. Митохондриальные гены не кодируют ни одного свойства организма. Они кодируют только саму митохондрию.
    3. Следовательно, митохондрии не формируют наследственность человека, но они формируют наследственность митохондрий.
    Спорить больше не буду. Сделаю скан статьи - предоставлю. A-ktubu 19:20, 11 февраля 2009 (UTC)

    По-вашему, если ядерные гены кодируются образование митохондрий, то клетка без митохондрий за счет ядра может de novo создать митохондрию?
    И почему то десятки наследственных заболеваний, связанных с нарушением митохондриальной ДНК вас не останавливают в том, чтобы делать антинаучные выводы. --Jegres Hydes (sirozha.ru) 05:26, 12 февраля 2009 (UTC)

    ОтветитьУдалить
  13. Strannik21 декабря 2012 г. в 14:51


    Митохондриальные заболевания-- Victoria 08:21, 12 февраля 2009 (UTC)

    Посмотрел. Много чего напутано в статье. Например, болезни, вызванные мутациями хромосомных генов, записаны за изменениями в митохондриях. Но самое интересное это то, что указана информация о переносе уже оплодотворённого ядра в безъядерную клетку с другими митохондриями. Вот так мы получаем ТРЁХ родителей. Первый - папа (его генный материал в ядре), вторая - мама (её генный материал также в ядре), а третий КТО? Чей материал в митохондриях? Второго папы ? :))) Второй мамы? :))) Соседа? :)))
    А суть спора в том, что на начальном этапе какой-то "учёный" посчитал, раз в митохондрии есть ДНК, значит эта ДНК влияет на наследственность всего организма. Этого "учёного" во время не поправили. "Кол" ему не влепили. Так и вырос митохондриальный Голый Король :))) A-ktubu 23:40, 14 февраля 2009 (UTC)

    Напутано не в статье.
    С использованием переноса ядра оплодотворённой яйцеклетки в безъядерную цитоплазму другой яйцеклетки с нормально функционирующими митохондриями (замена ядра). Участвует 1) ядро оплодотворенной яйцеклетки (папы и мамы) 2) цитоплазма другой яйцеклетки без ядра с митохондриями (вторая мама). На вопрос "Чей материал в митохондриях?" ответ очевиден -- "Второй мамы." Если вам ответ не очевиден, это не значит, что в статье напутано.
    Напутано не в статье. --Jegres Hydes (sirozha.ru) 06:06, 15 февраля 2009 (UTC)

    Спасибо Вам, за то, что ввели в статью геном митохондрий. Два различных геном - это два различных существа. Пройдёт ещё немного времени, и митохондриальная наследственность перейдёт в разряд финно-угорских сказок A-ktubu 01:28, 3 мая 2009 (UTC).

    ОтветитьУдалить
  14. Strannik21 декабря 2012 г. в 14:51

    Пропущенное слово

    что митохондрии сперматозоидов помечены убиквитином (белком-меткой, направляющим их в для дальнейшего расщепления).[5] В этой фразе пропущено слово, а какое - я не знаю. Неужели митохондрии направляются в протеасомы? Или их как=то разбирают на части? Хорошо бы это прояснить! Glagolev 12:00, 11 мая 2009 (UTC)

    In 1999 it was reported that paternal sperm mitochondria (containing mtDNA) are marked with ubiquitin to select them for later destruction inside the embryo.[10] --Sirozha.ru 03:37, 12 мая 2009 (UTC)

    Не прояснилось! Как же они разбираются? Glagolev 12:05, 12 мая 2009 (UTC)

    Кагбэ в оригинальной статье об этом не написано. Разбираются. Недавно в nature был цикл статей об убиквитинировании, можно там посмотреть--Sirozha.ru 14:49, 12 мая 2009 (UTC)

    ОтветитьУдалить
  15. Strannik21 декабря 2012 г. в 14:52


    Хехе, ни слова про плазмон. --Jegres Hydes (sirozha.ru) 09:33, 12 февраля 2009 (UTC)

    Не нравится лично Вам термин "плазмон" - я не настаиваю. Но то, что митохондрии не участвуют в наследственности организма - есть факт. A-ktubu 23:40, 14 февраля 2009 (UTC)

    ОтветитьУдалить

Подписаться на: Комментарии к сообщению (Atom)